Expérience

  1. Consultant digital senior

    Contractant indépendant

    Conception de produits numériques avancés et de solutions assistées par l'IA pour des clients privés.

    • Pilotage de projets numériques sur mesure
    • Workflows LLM agentiques et stratégie produit
  2. Senior Data Scientist

    GSK (anciennement GlaxoSmithKline)

    Pilotage d'activités de bioinformatique et d'analytics pour la R&D vaccins, entre développement de pipelines, conception de bases de données, génomique microbienne et génération d'hypothèses.

    • Intégration de données et de connaissances pour la génération d'hypothèses
    • Modèles exploratoires pour des jeux de données précliniques, cliniques et épidémiologiques
    • Conseil sur le design d'étude, le choix des readouts, la stratégie d'analyse et les publications
  3. Consultant en data science, biologie, éducation et IT

    Sinclair.Bio

    Missions de conseil à travers l'Europe pour des équipes de recherche, d'éducation et d'innovation, en combinant programmation, design et leadership scientifique.

    • Clients : EPFL, University of Warwick, Biomillenia, Arcadia, HUG, BRTA, University of Bergen, Insight Technology Solutions et Oxford IR, entre autres
    • Interventions allant de la data science et de la livraison logicielle au design UX/UI et à la formation technique
  4. Application Architect

    Commission européenne

    Simulation de modèles de dynamique de biomasse forestière dans 26 pays membres pour prédire l'impact des politiques européennes sur la séquestration du carbone.

    • Développement de packages Python pour collecter, harmoniser et comparer automatiquement des jeux de données forestières internationaux
    • Projections de l'offre et de la demande en produits bois selon différents scénarios jusqu'en 2050, en soutien aux politiques publiques
    • Publication de packages open source et d'articles évalués par les pairs
  5. Chercheur postdoctoral

    Université de Genève

    Études écologiques de communautés microbiennes à partir de données de séquençage ADN au sein du laboratoire de génomique environnementale.

    • Mise en place d'infrastructures d'analyse reproductibles
    • Automatisation des workflows statistiques et de la génération de visualisations
  6. Fondateur et CTO

    Envonautics AB

    CRO offrant des solutions complètes basées sur l'ADN environnemental (eDNA) pour la surveillance environnementale, avec une gestion intégrale de projet : de l'échantillonnage et du séquençage à l'analyse, jusqu'à la communication des résultats et la rédaction scientifique.

    • Évaluation et atténuation des impacts environnementaux
    • Création de logiciels et de pipelines sur mesure.
  7. Enseignant principal cours Python

    Université d'Uppsala

    Conception et enseignement d'un cours en Python intitulé « Practical Python Programming for Big Data and the Scientist » pour 20 doctorants dans le cadre du programme graduate.

    • Convaincu les parties prenantes et obtenu le financement
    • Recruté et coordonné deux assistants d'enseignement
  8. Assistant scientifique

    Plateforme de bioinformatique et biostatistique à l'EPFL

    Participation à plusieurs projets de recherche et développement d'outils pour traiter et analyser des données génomiques à haut débit.

    • Soutien bioinformatique sur plusieurs collaborations
    • Outillage Python pour l'analyse de séquençage
    • Collaboration au développement d'un navigateur de génome interactif en ligne

Education

  1. Université d'Uppsala

    Doctorat (PhD)

    Bioinformatique

    Construction de pipelines bioinformatiques ayant traité plus d'un milliard de reads de séquençage ADN pour caractériser des communautés microbiennes en milieux aquatiques (lacs boréaux, le Danube et lacs alcalins).

    • Auteur de 5 publications et publication de seqenv, un outil open-source reliant les séquences à leur environnement via recherche d'homologie NCBI et fouille de texte basée sur des ontologies
    • Reconstruction de génomes à partir de jeux de données métagénomiques, révélant des voies métaboliques inédites (photoferrotrophie, oxydation anaérobie du méthane) dans des écosystèmes d'eau douce
  2. EPFL

    Master of Science (MSc)

    Faculté des sciences de la vie (SV)

    Double spécialisation en bioinformatique et neurosciences computationnelles, avec un fort accent sur la biologie des systèmes et la modélisation quantitative.

    • Cours incluant biologie moléculaire computationnelle, apprentissage automatique, théorie des systèmes dynamiques pour ingénieurs, graphes & réseaux, etc.
    • Création et déploiement d'un vaste wiki en ligne pour l'échange de ressources entre étudiants
  3. EPFL

    Bachelor of Science (BSc)

    Faculté des sciences de la vie (SV)

    Filière STEM avec une base analytique large et une spécialisation en biotechnologie et bio-ingénierie.

    • Cours incluant analyse mathématique, physique, chimie, algèbre linéaire, informatique, etc.
    • Délégué de classe, membre de l'association étudiante de la faculté et du programme de coaching du campus

Certifications

  1. Project Management Prof. (PMP)

    Project Management Institute (PMI)

    Certification reconnue mondialement couvrant les approches prédictives, agiles et hybrides pour mener des projets, des équipes et des résultats opérationnels.

    • Couvre l'engagement des parties prenantes, le leadership d'équipe, la gestion des risques et du changement sur l'ensemble du cycle de vie du projet
  2. Formation pédagogique universitaire

    Université d'Uppsala

    Formation formelle à l'enseignement supérieur, à la conception de cours et à l'évaluation des apprentissages, qualifiant pour l'enseignement de niveau gradué.

    • 25 jours complets couvrant la conception de plans de cours, les retours en classe, les compétences de présentation, la pratique réflexive de l'enseignement, etc.